风水又称堪舆，是中国古代一种神秘的方术，主要通过对城镇、村落、建筑、目的的地形、方位的观测来确定选址和布局，达到趋吉避凶的目标。风水术经过历代传承，对中国古代城市和建筑影响非常深远，但今天对风水的评价存在着很大的茶几，有人认为其中包含着古代朴素的环境科学原理，有人认为主要反映的是封建迷信糟粕。
北京四合院属于“阳宅”的范畴，也有很多风水上的讲究。一般来说，考察一个宅院的选址好坏，要看它与周围道路、树木以及其他住宅的关系，同时对住宅平面的轮廓形状也有要求。
北京四合院以长方形为最吉，南窄北宽的梯形以及方形也算是吉地，而南宽北窄的梯形以及曲尺形则被视作不吉。
方位方面，坐北朝南是最好的朝向，也是大多数四合院的实际建造模式，其他的禁忌包括宅门不能正对着走路的走向，邻居住宅的房屋不能太高等等。
宅门一般位于东南方，厕所多在西南方，也都是从八卦方位得到的启示。
此外中国自古有一个成语叫“门当户对” ，但从风水的角度来讲，位于同一条胡同两侧人家的宅门是绝对不能相互直对的，据说会对两家主人有很大的妨害。不过从环境心理学的角度看，两家户门如果彼此相对，也确实会带来视线干扰的问题，并影响各自的出入。
中国风水最注重“藏风聚气”，这个“气”的含义很玄奥，有多种解释。通常宅门偏于一侧，门对照壁，便可防止“气”随便泄走。
另外北京人也重视“接地气”，就是认为人不能离开大地，一定要抓在与地面直接气息相通的平房中，所以即便设有楼阁，也主要用于观景和储藏东西，并不住人。
更讲究的风水师要使用一种叫做“门光尺”的特殊工具，这种尺又叫“鲁班尺”，上面每尺分为八寸，在刻度的位置分别标注“财”、“病”、“离”、“义”、“官”、“劫”、“害”、“吉”等字样，通过一套复杂的计算方法来确定建筑门窗的尺度。这些东西未免有故弄玄虚的嫌疑，不值得相信。
很多四合院受到先天条件的限制，很难完全符合风水的要求，总会有这样那样的缺陷。这些缺陷可以通过一些方法来进行调整和变通，包括设置影壁、石敢当以及在墙上挂一面镜子等等，据说都有改善风水的作用。
